In rete ho trovato la soluzione, che riassumo brevemente: in pratica bisogna forzare Thunderbird ad usare Firefox (o quello che si vuole). Per farlo è sufficiente entrare nella pagina di configurazione (edit, preferenze, avanzate, tasto “config editor” in basso a destra). A questo punto si apre la pagina di about:config; premendo il tasto destro e scegliendo nuovo si potrà inserire un nuovo campo (a noi serve una stringa) e, dopo, il relativo valore. I campi che ci interessano sono “network.protocol-handler.app” e spiegano al client come gestire determinati protocolli (cioè quale applicazione usare). Io ho impostato

network.protocol-handler.app.http con valore /usr/bin/firefox  (verificate la correttezza del path)

ed ho fatto lo stesso per l’https. Infine, per l’ftp, ho impostato filezilla.

Per fare la stessa cosa con firefox la procedura è identica; per arrivare alla pagina di configurazione è sufficiente inserire come url “about:config”. Io, ad esempio, ho inserito la coppia

network.protocol-handler.app.mailto e /usr/bin/thunderbird